【摘 要】
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目的:研究基于网络药理学探讨甘麦大枣汤抗抑郁的作用机制.方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药分子机制生物信息学分析工具库(BATMAN-TCM)及文献搜索获取甘草、小麦、大枣的活性成分及作用靶点,从GeneCards数据库获得抑郁症靶点,获得药物疾病交集靶点,通过String在线平台数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并利用Cytoscape软件进行可视化及拓扑学分析筛选核心基因,应用DAVID数据库完成基因本体(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的富
【机 构】
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北京中医药大学,北京,100029;北京中医药大学北京中医药研究院,北京,100029
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目的:研究基于网络药理学探讨甘麦大枣汤抗抑郁的作用机制.方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药分子机制生物信息学分析工具库(BATMAN-TCM)及文献搜索获取甘草、小麦、大枣的活性成分及作用靶点,从GeneCards数据库获得抑郁症靶点,获得药物疾病交集靶点,通过String在线平台数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并利用Cytoscape软件进行可视化及拓扑学分析筛选核心基因,应用DAVID数据库完成基因本体(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的富集分析.结果:共筛出中药活性成分94个,有效靶点49个,药物疾病交集靶点48个.PPI网络发现ALB、CASP3、VEGFA、MYC、CCND1、ESR1、CTNNB1、AR等可能是关键靶点.GO功能富集分析得到181个生物过程,主要涉及雌激素反应、胆碱能突触传递等.KEGG通路富集分析发现46个通路,主要集中在癌症相关通路、甲状腺激素信号通路、PI3 K/AKT信号通路、Wnt信号通路等.结论:本研究为甘麦大枣汤的药效物质基础的进一步研究提供了理论基础,同时为其在抗抑郁方面的应用提供了参考依据.
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心血管疾病已成为世界范围内的首要致死原因之一.其中天然免疫应答介导的炎症反应近年来成为心血管疾病的研究重点,TLR4是关键的免疫应答通路,可以激活多种炎症介质释放,引起炎症反应,在心血管疾病发生发展中起重要作用.研究表明,中药在防治心血管疾病中具有明显的优势,其防治机制可能与调节TLR4信号分子、抑制炎症损伤有关.现以TLR4信号通路为切入点,探讨中药通过TLR4防治心血管疾病的机制,对心血管疾病的发病机制及中医药防治心血管疾病的作用机制的深入研究提供参考.
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目的:基于网络药理学探讨山慈菇-浙贝母药对治疗乳腺癌的作用机制.方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集山慈菇、浙贝母的活性成分和靶点,并通过Uniprot数据库选择对应的药物作用蛋白质名称对应基因名,通过Cytoscape 3.7.2构建“药物-活性成分-靶点”网络图,同时检索疾病数据库(GeneCards)和在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获得乳腺癌相关靶点.使用Cytoscape 3.7.2构建“活性成分与乳腺癌交集靶点”蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并对PPI网络节点
目的:基于网络药理学探讨洪钦国教授运用温胆汤加减治疗慢性肾衰竭的潜在药理作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取温胆汤加减的化学成分、蛋白靶点;在GeneCards数据库上检索慢性肾衰竭相关疾病靶点.将药物所得靶点和疾病相关靶点进行映射交集,初步获得温胆汤加减治疗慢性肾衰竭的潜在作用靶点.运用String平台绘制温胆汤加减治疗慢性肾衰竭的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,最后在Metascape数据库平台进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富
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