蒙农红豆草花瓣转录组微卫星SSR特征分析

来源 :西北农林科技大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qqanjun
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【目的】对蒙农红豆草花瓣转录组微卫星SSR特征进行分析,为开发新的分子标记及探明各类性状的遗传机制研究奠定基础。【方法】以蒙农红豆草突变群体中浅色花瓣和紫红色花瓣(对照)为试验材料,通过Illumina HiSeqTM 2000对其进行高通量测序和组装,利用MISA软件对其所有Unigene进行SSR搜索,并对SSR分布及其序列特征进行分析。【结果】在蒙农红豆草转录组数据中共获得53009条Unigene,其中6202条Unigene上分布了8175个SSR位点,每5.86 kb就有1个SSR位点;重复基
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