【摘 要】
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目的 从日本血吸虫基因组中筛选鉴定类毒过敏原基因,并分析其编码蛋白的生物学特性. 方法 基于日本血吸虫基因组筛选出类毒过敏原基因序列,并进行PCR验证;通过生物信息学方法
【机 构】
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中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所,国家热带病研究中心,世界卫生组织热带病合作中心,科技部国家级热带病国际联合研究中心,卫生部寄生虫病原与媒介生物学重点实验室,上海200025;遵义医科大学
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目的 从日本血吸虫基因组中筛选鉴定类毒过敏原基因,并分析其编码蛋白的生物学特性. 方法 基于日本血吸虫基因组筛选出类毒过敏原基因序列,并进行PCR验证;通过生物信息学方法分析该基因编码蛋白的结构特征,包括疏水区、跨膜区、信号肽及结构域,以及编码蛋白质的二级、三级结构及其抗原表位;利用Clustal-X 2.1软件对其编码的氨基酸序列进行同源比对;利用MEGA X软件构建系统发育树;通过STRING数据库对其蛋白互作网络进行预测.结果 从日本血吸虫基因组中筛选鉴定出1条具有完整编码区的类毒过敏原基因序列,其长度为486 bp,编码161个氨基酸;预测其编码蛋白相对分子质量为18.938 91×105,为分泌蛋白;其5'区域包含一个信号肽,无跨膜区,推测具有7个抗原表位.以STRING在线数据库中线虫蛋白互作网络信息作为参考,对血吸虫类毒过敏原蛋白互作网络进行预测,共鉴定出包括10个蛋白在内的16个互作关系. 结论 从血吸虫基因组中筛选出1条类毒过敏原蛋白基因,生物信息学方法预测其为分泌蛋白,并含有一定数量的抗原表位,为该蛋白作为候选疫苗和诊断抗原提供了分子基础.
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