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采用随机扩增多态性DNA（RAPD）方法对两种紫萼藓科植物的6个居群的60个个体进行遗传多样性分析。用11个随机引物扩增出清晰谱带52条。聚类结果表明：紫萼藓科两种植物的6个自然居群显然聚为两大支，一支为东亚砂藓．另一支为毛尖紫萼藓。介绍了紫萼藓科植物6个自然居群及东亚砂藓与毛尖紫萼藓的遗传变异情况。