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鉴于多标签传播算法在发现社会网络的社区结构研究上具有快速、高效的求解能力，提出融合多源蛋白质生物学知识的基于多标签传播机制的蛋白质相互作用（PPI）网络功能模块检测算法．首先，结合PPI网络功能信息和结构信息初始化节点的标签．然后，利用基因表达数据描述蛋白质问的共表达性，依据共表达性构建标签集合，从中选择标签以实现标签在节点间真实可靠的传播．最后，将具有相同标识符的节点划分到同一功能模块中，获得最终结果．实验表明文中算法不仅具有良好的时间性能，而且在检测精度上也具有一定的竞争性．