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高新技术产业具有高风险、高附加值的特点，对经济的推动作用巨大。上海在高新技术产业发展方面，一直走在我国的前列。面对新的国际、国内经济形势，结合上海自身的特点，科学的选择高新技术主导产业对于上海经济的快速发展意义重大。本文分析了区域高新技术主导产业选择的指标体系，建立了相应的选择模型，并对上海的高新技术产业进行了实证分析，以期为高新技术主导产业的选择做出科学、合理的决策。