烟草叶绿体密码子的偏好性及聚类分析

来源 :中国烟草学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sy_2005
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综合运用多种软件对3种烟草属植物以及其他对照植物的6个叶绿体蛋白编码基因进行了分析。结果表明,普通烟草在密码子使用特性上与林生烟草最为接近,在所分析的59个密码子中,有39个密码子的RSCU(Relative Synonymous Codon Usage)值完全一样;8种参与分析的植物中共出现了30个具有偏好使用的密码子,其中7种双子叶植物在碱基组成上偏爱以C结尾的密码子,而水稻偏爱以T和C结尾的密码子;以RSCU值为基础的聚类结果显示出植物的密码子偏好性具有种族特征,表明基于叶绿体蛋白编码基因的密码子使
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