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元基因组学是一门直接取得环境中所有遗传物质的研究方法,主要研究通过提取某一环境中的所有微生物基因组DNA,构建基因组文库及对文库进行筛选寻找和发现新的功能基因及活性代谢产物。它开辟了一个研究微生物多样性的新时代,打破了传统培养技术在微生物资源开发利用上的限制因素,极大地扩展了99%不可培养微生物资源的利用空间。同时也扩大了人们对环境微生物多样性的认知。目前,元基因组技术在医学、生物能源、生态环境保护和农业等方面都取得了很大的进步。本文回顾了当前发展的元基因组的研究方法及其应用。