不同发育阶段小尾寒羊皮肤毛囊特异性miRNA的鉴定

来源 :农业生物技术学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:foxbill_csdn
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
小尾寒羊(Ovis aries)是我国优良的肉裘兼用型绵羊品种,因其生长速度快、产羔率高而闻名。microRNA (miRNA)是参与转录后表达水平调节的重要因子,可参与调控多种动物的皮肤和毛囊的发育。为了阐明miRNAs在小尾寒羊皮肤毛囊发育过程中的调控作用,本研究利用高通量测序技术分析了成年(XWHY1)、出生30 d (XWHY2)、刚出生(XWHY3)等3个时期小尾寒羊皮肤毛囊组织的miRNAs表达谱,在3个不同发育时期共鉴定出1 062个miRNAs,包括已知miRNAs 160个,新发现miRNAs 902个。对鉴定出的miRNAs进行统计分析,在XYHY1、XYHY2和XYHY3中特异性表达的miRNAs数目分别为69、127和73个,而在3个时期共表达的miRNAs为666个。统计分析采用费舍尔精确检验(Fisher exact test)和卡方检验(Chi-square test),对同时满足|log2(FoldChange, FC)|≥1且P≤0.05的差异表达miRNAs进行统计,经XWHY1、XWHY2、XWHY3两两比较筛选出339个差异表达miRNAs,去重复后得到226个差异表达miRNAs;进一步进行靶基因预测,得到2 645个靶基因。对差异表达miRNAs进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路(Pathway)富集,2645个靶基因注释到181个信号通路;对差异表达miRNAs进行基因本体(gene ontology, GO)富集分析,主要包括转录调控、细胞膜组成和离子结合等过程。本研究为在miRNA水平解析皮毛/绒性状形成的分子机理提供了基础资料,同时为保持小尾寒羊现有优良品质的同时通过人工调控手段提高毛/绒产量及品质提供了新的思路。
其他文献
目的分析血清泌乳素(PRL)水平与浆细胞性乳腺炎复发的相关性。方法选取2016年6月至2019年5月郑州大学第一附属医院收治的62例浆细胞性乳腺炎患者作为观察组,治疗后复发14例,
【正】一、基本情况国家外汇管理体制的全面改革,有力地促进了我区外贸事业的发展,1994年我区进出口总值首次突破10亿美元大关,创造了历史的最好水平,出口增长12.2%.但是从19
【正】电梯已成为人们日常生活中不可缺少的工具。由于PLC的可靠性高,程序设计方便灵活等优点,在电梯控制方面,获得了较为广泛的应用。本文将介绍西门子S7-200PLC在电梯控制
通过对东北大学、辽宁大学等沈阳地区8所高校近1500名在校本、专科生和研究生的调查,对大学生利用图书馆与互联网的状况进行了系统分析。具体包括:图书馆图书借阅量分析;图书馆
在很多农村地区,户外散养都是当地畜禽养殖的主要方式。相对圈养,这种畜禽养殖方式能为动物提供更大范围的活动空间,开放性更强。且喂养的食物或饲料,也大都是来自养户,没有
中小企业一直以来都是我国经济社会发展的重要推动力,在促进科学技术创新、吸纳城镇农村剩余劳动力、创造经济价值等方面都做出了至关重要的贡献。但是,次贷危机后,各商业银行严
针对南宁市地铁3号线金埌区间盾构在复合地质条件下下穿既有运营地铁1号线隧道,且存在下穿段原地铁1号线预加固效果差的特殊情况,通过设置试验段对盾构掘进参数进行初步设定,
针对职高语文课堂活力不足的问题,笔者通过对当前社会“穿越”盛行的启示,基于建构主义、共情理论,从教材、教师、学生等课堂三要素深入探索了职高语文课堂“穿越”教学的途径和
惠普公司近日宣布扩展墙面装饰数字印刷解决方案,帮助打印公司和墙纸制造商为商务、零售和住宅空间提供高价值墙面装饰产品,开发新机会。惠普数字打印解决方案采用HPLatex打印
检验是锅炉管理工作中的重要内容,直接关乎锅炉的安全运行。锅炉的运行长期处于高温环境中,会出现锅炉壁破裂等问题。因此,采用无损检测技术对锅炉压力管道进行检测非常必要