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本文分析了当代科学实在论者在对科学理论中的理论实体的本体论地位作回答时，所设标准陷入方法论和认识论困境的主要原因，提出了在统一认识的基础上，暂时将实在概念在认识的不同阶段分层次、区别开来的研究方法。文章认为，在科学哲学研究中，只有用这种随着科学的发展不断地得到补充和深化的方法来解释、评价和说明现代科学理论中的实在性问题，才能达到本体论、认识论和方法论的统一，才能确立合理的科学观、价值观及其真理观。