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渔业生态经济学是研究渔业生态系统与渔业经济系统相互作用和协调关系的一门边缘综合科学。它以渔业生态系统与渔业经济系统作用构成的渔业生态经济系统作为研究对象，以渔业生态系统的运转为基础，研究渔业经济系统与渔业生态系统的协调、制约关系，以获得最大的综合生态经济整体效益，从而达到对自然渔业生态经济资源的最优生态经济配置。