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甜瓜(Cucumis melo)长果柄品种有利于规模化生产与机械化采收.本研究利用长果柄甜瓜'1244'和短果柄甜瓜'MS-5'配置杂交组合,构建F2分离群体,利用特异性位点扩增片段测序(specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF-seq)技术构建甜瓜遗传图谱,结合SSR分子标记,对果柄长度(fruit peduncle length,fpl)进行QTL定位.构建的甜瓜遗传图谱包含12个连锁群,获得了10595个上图标记,总图距为1383.88 cM,标记间平均距离为0.13 cM;甜瓜果柄长度受2对主基因控制,fpl1.1定位在甜瓜1号染色体CMSSR05887和CMSSR05892之间,表型贡献率为12.2%,QTL候选区间位于甜瓜scaffold0006057524~270836;fpl8.1位于8号染色体CMSSR20549和CMSSR20495之间,表型贡献率为13.2%,QTL候选区间位于scaffold0005894748~105498.研究结果为甜瓜分子标记辅助选择育种及甜瓜机械化采收研究提供理论依据.