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自从1960年，Barrett和Jordan证实抗凝治疗可以降低肺栓塞患者的死亡危险以来，肝素就开始用于治疗血栓栓塞性疾病。最初肝素的用法是每4小时静脉内推注一次，直到后来临床试验发现连续静脉滴注普通肝素出血并发症少。连续静脉滴注普通肝素时需要监测活化部分凝血活酶时间（Activated partial thromboplastin time，aPTT），使之维持在对照的1．5—2．5倍。应用普通肝素常规为首剂推注负荷剂量5000U，然后每小时1000U静脉滴注。