基于WGCNA分析挖掘大白菜叶柄黑点症发生相关基因

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大白菜叶柄黑点症是造成大白菜商品性降低的一种生理性病害,本研究是为了明确大白菜叶柄黑点症发生的分子机制。以抗大白菜叶柄黑点症品系(韩春娃C8-1)和感叶柄黑点症品系(韩春娃-4-2-3-4)为材料,通过正常N和高N水平水培处理,处理前和处理后7 d及14 d分别取样,进行转录组测序和加权基因共表达网络分析(WGCNA)分析,挖掘与大白菜叶柄黑点症发生相关的基因。本研究共对30个样品进行转录组测序,获得201.58 Gb Clean Data。通过WGCNA分析,抗性品系3个模块与N水平相关性绝对值均小于0.5,因此没有获得与N水平相关的模块;通过WGCNA分析,感性品系共获得6个模块,其中1个与N水平相关的模块(相关性绝对值为0.69)。此模块共包含48个基因,涉及17个KEGG代谢通路。大白菜叶柄黑点症发生相关基因的挖掘,为研究大白菜叶柄黑点症发生的分子机制提供了理论基础和依据。
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