【摘 要】
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[目的]探明贵州地方特色柑橘种质牛肉红朱橘(NRH)抗氧化生物合成关键基因及表达特征,揭示其抗氧化生物活性的形成机理,为地方柑橘资源的开发利用提供依据.[方法]利用RNA-Seq技术对NRH及其亲本朱红橘(ZHJ)进行转录组测序分析.[结果]除去低质量数据后Clean reads数为(3.93～4.49)×107个,总净核苷酸数为(5.89～6.73)×109个;在阈值为| log2 (FoldChange)|＞0和padj＜0.05时,共筛选到1282个差异表达基因,其中上调833个,下调449个.GO
【机 构】
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贵州省农业科学院果树科学研究所,贵州贵阳550006
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[目的]探明贵州地方特色柑橘种质牛肉红朱橘(NRH)抗氧化生物合成关键基因及表达特征,揭示其抗氧化生物活性的形成机理,为地方柑橘资源的开发利用提供依据.[方法]利用RNA-Seq技术对NRH及其亲本朱红橘(ZHJ)进行转录组测序分析.[结果]除去低质量数据后Clean reads数为(3.93～4.49)×107个,总净核苷酸数为(5.89～6.73)×109个;在阈值为| log2 (FoldChange)|＞0和padj＜0.05时,共筛选到1282个差异表达基因,其中上调833个,下调449个.GO功能富集分析共富集到9个差异类别.KEGG功能富集分析的代谢通路主要包括核糖体、淀粉和蔗糖代谢、类胡萝]素生物合成、MAPK信号通路和苯丙烷生物合成等.[结论]鉴定出2条与抗氧化密切相关的代谢通路,即类胡萝卜素(7个差异基因)和苯丙烷生物合成途径(16个差异基因),其中17个基因在NRH中上调表达,6个下调表达.
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