HSV-2的生物信息学分析及其Oligo探针设计

来源 :山东医药 | 被引量 : 0次 | 上传用户：gujianjia

【摘要】

：

目的设计单纯疱疹病毒2型(HSV-2)诊断芯片的Oligo探针.方法利用BLAST软件对HSV-2的DNA序列进行序列比对,得到有意义的特异序列;用生物学软件Oligo6.0设计特异性高、Tm值相近

【作者】

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赵海全马文丽莫小阳张亚莉郑文岭

【机构】

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南方医科大学基因工程研究所

【出处】

：

山东医药

【发表日期】

：

2005年35期

【关键词】

：

单纯疱疹病毒2型生物芯片 Oligo探针 BLAST软件 HSV-2 biochip oligonucleotide probe basic local

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目的设计单纯疱疹病毒2型(HSV-2)诊断芯片的Oligo探针.方法利用BLAST软件对HSV-2的DNA序列进行序列比对,得到有意义的特异序列;用生物学软件Oligo6.0设计特异性高、Tm值相近、长度均一的Oligo探针.结果获得13条60-mer Oligo探针.结论利用BLAST系统和生物学软件Oligo6.0设计HSV-2诊断芯片的探针,可为后期打印成DNA芯片,用于HSV-2的检测打下基础.

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