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证候晶体学是研究中医证候的一门科学，它主要研究证候晶体结构与层次，晶体间相互作用及其变化规律。证候晶体学的结构是证与相应的方药耦合系统，其内涵是晶体结构所规定的病机态势，其外延是晶体所规定的排列组合之积数。证候晶体学研究的意义在于揭示证候的自身规律及特点，为证实质，证候规范化的研究，提供新的思维方法，为建立证候诊断标准，以及相应软件的开发与应用开辟一条新的途径。