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在产业准入负面清单制度背景下，国家重点生态功能区的农业政策和实践既承载着传统农业发展模式的惯性和压力，又面临转向生态空问管控、发展生态农业的战略机遇。文章分析了重点生态功能区农业生态化发展可能面临的有利条件和挑战，并从充分认识地方政府与中央政府之问的不同考量、调整发展理念和方式、推动重点生态功能区实行差异化的农业政策、推动多规合一和协同治理、创新生态补偿模式等方面提出了重点生态功能区走生态化农业发展道路的政策建议。