水稻条纹病毒楚雄分离物一个重组RNA序列分析

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为检测水稻条纹病毒(Rice stripe virus,RSV)基因组存在的重组RNA,采用RT-PCR方法扩增并克隆云南楚雄分离物(YCX07)的RNA重组片段YCX07R。克隆重组片段并测定序列。序列分析表明,YCX07R由RSV RNA2的3’端序列与RNA3的3’端序列重组而成,具有RSV基因组结构特征,采取双义编码策略,即在正、负链的5’端分别存在一个阅读框,编码两个重组蛋白YCX07R-5P、YCX07R-3P。分析推测重组更可能通过类似于脊髓灰质炎病毒(Poliovirus)的引物互补延伸机制发生。
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