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通过对我国2012 2016年发放的转基因抗虫棉生产应用安全证书（简称“安全证书”）的分析，发现我国抗虫棉育种研究呈现以下趋势，一是以科研院所和教学单位为主的佥益性研究单位是获批抗虫棉安全证书的主体，二是黄河流域抗虫棉育种研究优势明显，三是种子企业抗虫棉安全证书获批数量下降明显，四是西北内陆棉区抗虫棉品种储备增多。同时笔者对抗虫棉安全证书续申请问题进行了探讨，提出简化安全证书审批和管理的建议。