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石炭系（仅存黄龙组）是川东、川东北乃至鄂西地区碳酸盐岩地层中最重要的一套储集层，但分布并不稳定，有些地区呈零星状分布甚至完全缺失。通南巴构造周边露头区二叠系直接与志留系不整合接触，未发现石炭系。但在地震剖面上，Tp1(二叠系底界）反射之下、志留系弱反射之上有呈断续状分布的反射，并与零星分布的波阻抗大于230×10^5kg/m^2·s高阻抗区域相对比。这些特征说明通南巴构造腹部存在石炭系。