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生物工程是嘉应学院首批重点建设学科之一，学术带头人是刘志伟博士。目前主要有两个研究方向：1．发酵与食品工程。主要研究生物工程中下游技术，重点开发应用型项目，以发酵工程为基础，分别向上游和下游扩展，开展植物细胞培养生产次级代谢物的研究和生物物质的生产技术研究，并将生物技术与食品工程相结合，利用各种天然物质，开发绿色环保的健康食品。