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[目的]研究江苏地区杨梅（Myrica rubra Bieb.et Zucc）的亲缘关系。[方法]用ISSR-PCR方法对18个江苏地区杨梅品种（系）进行分析,并用UPGMA法构建分子系统树。[结果]筛选出的9个引物共扩增出70个DNA片段,其中多态性片段43个,占扩增总片段的61.4%;所分析的18个杨梅品种（系）在遗传距离0.14处分为6组,说明江苏杨梅在基因交流的基础上,有局部隔离。[结论]为杨梅种质资源的保护、利用及新品种的培育提供了科学依据。