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通过SSRFINDER软件搜索绒毛状烟草基因组DNA,设置条件是重复单元长度2~5 bp,重复次数10～60,共找到6 441个SSR位点,涉及5 227个Scaffold,SSR序列总长为303 963 bp,约占全基因组的0.12‰,即绒毛状烟草基因组中平均每400 kb会出现一个SSR位点。在所有SSR位点中,二、三碱基重复基元分别占总数的45.2%和49.6%,重复单元的重复次数10～20之间的SSR位点占总数的74.6%。