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许叔微伤寒著述今存《伤寒百证歌》《伤寒发微论》《伤寒九十论》3种。这3部书成书后流传不广,虽然有元、明刊本,但一直沉寂不显,直到清代才渐有医家征引。通过比对文本发现,《伤寒百证歌》之名见于许叔微的其他医著中,而《伤寒发微论》与《伤寒九十论》有部分内容则相互重复,甚至观点相异。由史料考察可知,许叔微现存的3部医书在北宋末年已经开始撰写。南宋初年渡江之后,许叔微整理残稿,在此基础上继续写作。其中《伤寒百证歌》最先成书,《伤寒发微论》次之,《伤寒九十论》成书最晚。