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为了降低外界对双目显微镜系统造成的干扰,本文提出一种基于误差筛选的标定方法。通过对每组数据进行重投影误差计算分析,剔除不能描述双目显微系统的数据,经过对比试验,结果表明:显微镜环境的特殊性使得采集到的图像容易受到外界信息的干扰,通过文中方法对数据进行清洗后,可达到降低标定误差的目的。利用本文方法在三种常用物镜倍率下进行相机标定,通过对比实验结果,得到了在显微镜环境下放大倍率和标定焦距成正相关关系。