甜橙COR413基因家族的鉴定和生物信息学分析

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:seraphim0113
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冷适应蛋白(cold-regulated, COR)是植物中特有的能参与植物低温胁迫调节的功能因子。为解析甜橙耐寒分子机制,本研究利用生物信息学方法在甜橙基因组中鉴定到7个CsCOR413家族成员,主要分布在1,2和5号染色体上。CsCOR413编码的蛋白均具有疏水性、无信号肽,除Cs2g03960.1外,其余6个CsCOR413蛋白具有跨膜结构域。亚细胞定位预测分析显示,CsCOR413蛋白定位于质膜或叶绿体中。对甜橙和拟南芥的COR413家族蛋白进行N-J聚类分析发现,CsCOR413成员可分为PM和IM两个亚族,同一亚族的CsCOR413基因结构、蛋白保守基序分布和磷酸化位点数量相近。本研究结果将为该基因家族成员在甜橙抗寒育种中的应用提供参考依据。
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