采集了3个不同主产区32批种植或野生乌拉尔甘草药材,采用指纹图谱、LC-TOF/MS及HPLC多指标成分分析结合模式识别（PCA和OPLS-DA）对不同主产地甘草样品水溶性特征组分进行差异性分析。32批次药材指纹图谱相似度在0.903～0.999,相似度较高;采用模式识别可以将甘肃、新疆种植药材与内蒙古种植药材及野生药材进行区分,进一步以LC-TOF/MS及对照品对照鉴定了指纹图谱中31个共有峰成分,并对其中4个黄酮苷及5个三萜皂苷特征组分含量进行了对比分析,结果表明3个产区种植甘草药材中5个三萜皂苷总含量差异不明显,但4个黄酮苷总含量呈现出内蒙古>甘肃≈新疆的趋势（P<0.05）,而野生药材与种植药材相比4个黄酮苷及5个三萜皂苷总含量均有显著提升（P<0.01）;其中,甘肃与新疆种植药材在甘草苷、异甘草苷、甘草皂苷A₃、22β-乙酰甘草酸及乌拉尔皂苷B上的含量均要低于内蒙古地区种植药材,但主要指标性成分甘草酸在3个产区药材中含量差异并不明显,而在内蒙古产区内的野生药材比家种药材在甘草苷、异甘草苷、甘草皂苷A₃、甘草皂苷G₂及甘草酸含量上均有显著升高。多指标成分定性/定量分析结合模式识别能有效评价不同区域种植及野生甘草的质量,有助于深入了解不同区域甘草的现状,可为甘草的资源开发与综合利用提供科学依据。