转型期阻碍民营企业发展的制度因素包括来自外部宏观环境和内部微观环境两个方面,其中政府宏观制度层面对民营企业发展的障碍尤为突出,政府为实现经济增长和自身利益的双重目标内生出阻碍民营企业发展的制度安排,使民营企业在融资、市场准入、行政审批和税收负担等方面与国有企业相比处于不公正的待遇。另一方面民营企业在对待宏观制度创新与微观制度创新的关系认识上也存在一定的片面性,片面地把民营企业存在的种种问题归结为外部制度环境障碍,从而导致企业经营管理过分依赖外部制度创新的价值取向。这两个方面一定程度都阻碍了民营企业的持续健康发展。随着民营企业在国民经济中的地位和作用的增强,政府应通过转变实现目标的途径、重塑政府机构及官员的利益结构,加强对政府机构的管理和约束,有效化解阻碍民营企业发展的制度安排;同时,民营企业应减少对外部制度依赖,努力通过微观制度创新提升其竞争力,促使民营企业的持续健康发展。