【摘 要】
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早期快速诊断是防控呼吸道病毒传播的有效手段,研发灵敏、特异、快速的分子检测技术方法是早期防控的前提和保障。本研究建立同时快速检测甲型流感病毒(Influenza A virus,FluA)、副流感病毒1型(Human parainfluenza virus 1,HPIV-1)、呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)通用型、人偏肺病毒(Human metap
【基金项目】
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南京海关(原江苏出入境检验检疫局)立项课题(项目号:2017KJ44),题目:国际班轮空气致病病原体富集及检测的研究;南京海关(原江苏出入境检验检疫局)立项课题(项目号:2019KJ05),题目:新发及输入性传染病口岸快检关键技术研究;
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早期快速诊断是防控呼吸道病毒传播的有效手段,研发灵敏、特异、快速的分子检测技术方法是早期防控的前提和保障。本研究建立同时快速检测甲型流感病毒(Influenza A virus,FluA)、副流感病毒1型(Human parainfluenza virus 1,HPIV-1)、呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)通用型、人偏肺病毒(Human metapneumovirus,HMPV)、人博卡病毒(Human bocavirus,HBoV)通用型和腺病毒B型(Adenovirus type B,AdVB)6种呼吸道病毒重组酶聚合酶扩增(Recombinase polymerase amplification,RPA)检测体系新的技术方法。选择人β-actin基因外显子区域序列作为内标基因,根据6种病毒特异性基因的保守区设计引物探针,结合商业化的逆转录重组酶聚合酶扩增(Revers transcript recombinases polymerase amplification,RT-RPA)反应试剂,优化体系的引物及探针浓度、温度、反应时间,构建6种病毒的RT-RPA检测体系。优化后病毒和内标基因的RT-RPA检测引物和探针终浓度分别为400nmol/L和200nmol/L,最佳反应温度为39℃,最优反应时间为15min。敏感性实验结果表明,本研究建立的RT-RPA反应体系对6种病毒的敏感性为1.0×10~4拷贝/mL,其中,对AdV-B的敏感性高达1.0×10~3拷贝/mL;特异性试验结果表明,不同病毒间特异性好,无交叉反应;重复性试验结果表明,6种病毒对高浓度(1.0×10~7拷贝/mL)和低浓度(1.0×10~4拷贝/mL)标准品检测出峰时间T变异系数小于5%,重复性好;对100例临床标本进行回顾性实验测试,与市售实时荧光PCR检测试剂盒的阳性符合率、阴性符合率和总体符合率均为100%。本研究提示,建立的RT-RPA检测体系可用于国境口岸对上述6种呼吸道病毒的日常监测与快速检测。
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