【摘 要】
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目的:对蛇足石杉的单核苷酸多态性(SNP)及微卫星短序列重复多态性(SSR)进行分析。方法:用HISAT、GATK、MISA等软件对蛇足石杉转录组筛选得到SNP和SSR并设计了SSR引物。结果:
【基金项目】
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黔南州科技与知识产权局基金项目(黔南科合社字201602);黔南民族医学高等专科学校科研基金项目(QNYZ201602)
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目的:对蛇足石杉的单核苷酸多态性(SNP)及微卫星短序列重复多态性(SSR)进行分析。方法:用HISAT、GATK、MISA等软件对蛇足石杉转录组筛选得到SNP和SSR并设计了SSR引物。结果:共发现50388个SNP位点,转换占64.2%,颠换占35.8%。共筛选出11934条SSR,分布在9358个unigene中,其中含有两条以上SSR的unigene有1786个。二核苷酸重复出现频率最多,占总SSR47.6%,三核苷酸重复占31.2%,六核苷酸重复占10%、单核苷酸重复占4.2%、四核苷酸重复占3
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