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目前，企业对新版GMP执行心存忐忑缘于两方面：一是投入产出比；二是技术设备能否满足要求。据测算，如果单独改造空气净化系统，企业需要投入100万元左右，全国总计投入2．98亿L元。国产冻干粉针机价格在2000万-3000万元之间，最低也得1000万元以上。仅更换该设备一项，预计全国的投入为60亿～90亿元。与此同时，有关专家提醒，我国从1998年开始进行GMP认证、2004年第一次在全国强制性推行GMP以来，全国在GMP认证方面的总投资已达1500亿元，其中40％为银行贷款。