【摘 要】
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HULC(highly upregulated in liver cancer)属lncRNA(长链非编码RNA),调控细胞自噬,在肝癌组织中高度上调表达。本文利用生物信息学数据库和实时荧光定量PCR技术对三唑磷处理
【机 构】
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浙江理工大学生命科学学院生物工程研究所,杭州,310018;浙江经贸职业技术学院应用工程系,杭州,310018
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HULC(highly upregulated in liver cancer)属lncRNA(长链非编码RNA),调控细胞自噬,在肝癌组织中高度上调表达。本文利用生物信息学数据库和实时荧光定量PCR技术对三唑磷处理后斑马鱼中lncRNA HULC调控机制进行研究,进一步了解lncRNA-miRNA-mRNA的调控网络,并且深入了解农药三唑磷对斑马鱼的环境毒理影响。基于芯片技术检测HTT、HOTTIP、NEAT1、NPPA和HULC的表达情况,三唑磷处理斑马鱼前后HTT表达无差异,HOTTIP表达略微下调,NEAT1、NPPA和HULC出现明显上调表达。软件RegRNA 2.0预测出dre-miR-2185*等7条miRNA与HULC发生相互作用,进一步预测其调控靶基因,构建调控网络。荧光定量PCR结果表明,HULC表达上调1.5倍、dre-miR-2185*表达下调6.63倍和离子型谷氨酸受体基因gria1a表达下调2倍。同时三者都可作为生物标志物来监测化学物质对环境和生物体的影响,以期对肝癌等相关疾病提供新的治疗方法。
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