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吉林省大黑山钼矿赋矿岩体主要为花岗闪长岩及角砾岩,与成矿相关斑岩为花岗闪长斑岩,斑岩含矿性较差。矿床发生多阶段钼矿化叠加活动：Ⅰ-细石英网脉阶段、Ⅱ-较宽石英网脉阶段、Ⅲ-宽石英网脉阶段、Ⅳ-石英大脉阶段,其中Ⅱ、Ⅲ阶段为主成矿阶段。矿区内不同阶段含矿节理统计玫瑰花图及等密度图结果显示：前三阶段含矿裂隙的形成与斑岩体的侵入密切相关,第Ⅳ阶段的石英大脉走向主要为北西向,可能受区域北西向构造活动的影响;含矿裂隙研究表明大黑山钼矿为典型的斑岩型矿床。