紫芝栽培品种'武芝2号'('紫芝S2')全基因组测序及分析

来源 :生物技术通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhiyin1976
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
采用PacBio SMART技术并基于三代和二代数据(3+2策略)完成紫芝栽培品种\'武芝2号\'(原名:S2)(通称\'紫芝S2\')基因组De novo测序、组装,完整地获得紫芝栽培品种\'武芝2号\'(原名:S2)全基因组,序列总长度56.849 Mb,包括核基因组和线粒体基因组共72条Scaffolds.其中,核基因组16681个基因,完成其中13161个基因的注释,约占总数的78.89%;预测分析到4组串联重复的rRNA簇、405个非编码RNA和3305个启动子,并找到rpb2、beta-tubulin和18S,28S rRNA(SSU,LSU)等基因序列以及漆酶同工酶基因,鲨烯合酶、羊毛甾醇合酶基因与麦角甾醇合成代谢相关基因及其分布位置,为今后紫芝栽培品种(系)分子鉴定与菌株鉴别、功能基因的挖掘与利用提供可靠信息,同时也为其后续开展中国栽培灵芝种类的比较基因组学分析积累科学数据.
其他文献
问题表征是问题解决的起点,在初中生物学日常教学中,教师应重视以问题表征具体方法为引领,例如,标注关键信息、运用图解、使用数学符号、编制信息分析表等,加强对学生问题表征能力的训练,使学生常常亲历问题表征过程,提升解决新问题的信心和能力.
在植物学实验教学中,通过增加新鲜实验材料进行观察,发现黄豆芽是一种非常优良的实验材料.黄豆芽具有取材方便、价格低廉、操作简易等特点,可用于观察植物输导组织、保护组织、根的初生结构和胚轴的结构等实验内容,可有效提高学生学习积极性.
新课程标准强调构建学科大概念,基于大概念的教学鼓励使用项目学习的方式整合课程内容,激发学生的探索实践.项目学习可充分调动学生的积极性,在真实情境中培养学生的科学思维.对围绕大概念的初中生物学项目学习资源进行整合有积极意义,为师生提供了形成大概念的具体抓手.以“生态系统的稳定性”一课为例,从整合基础、整合方向及整合路径3个方面阐述了资源整合的策略及借鉴意义.
利用青霉是空气中的优势菌且可生长在多数含有有机物的基质上的特征,选用鸡精液体培养基培养得到大量青霉菌.培养方法的优化使得学生更易制得目标青霉菌临时装片,降低实验难度,在显微镜下也可快速观察到大量青霉的典型结构.此方法所需培养条件简单、操作简便易行,具有推广价值.
天然黑色素是一种由生物细胞合成并分泌的多羟基吲哚或多羟基酚类聚合物,具有溶于碱而不溶于水和其他有机溶剂的特性,在各种动物、植物和微生物中广泛存在.当前研究已表明,天然真菌黑色素具有多种生物活性,其在多个领域均有广泛应用,是一种重要的生物材料与资源.本文综述了真菌黑色素的分类、结构、合成途径、理化性质及生物活性等研究现状,指出真菌黑色素在生产应用中具有极大的潜力和价值;进一步通过综合比较浸提法、超声波辅助提取法、超声波-微波辅助提取法和酶-超声波协同提取法等4种真菌黑色素制备方法,为产业上高效制取真菌黑色素
水蚤是目前初中生物学实验所涉及到的为数不多的活体材料之一.水蚤身体半透明,在显微镜下能较为方便地观察其心脏、测定其心率.研究影响水蚤心率的各类可控因素,并改进观测措施,以帮助学生准确计数水蚤心率.
近年来,牛樟芝以其稀有的资源和独特的功效逐渐被人们关注.越来越多的研究表明牛樟芝子实体、菌丝体和发酵液中均含有大量三萜、多糖等功效成分,也有公开报道其部分化合物具有抑制肿瘤、抗氧化、抗炎症等重要功效.本文对已公开报道的牛樟芝主要化合物、生物和化学合成及其药理功效等进行较全面的整理,对于牛樟芝产业的发展提出期望并指明方向,以期为牛樟芝在药物研究、开发、应用和提升牛樟芝商品化程度、市场价值等方面提供科学参考,促进牛樟芝在我国及世界的发展.
为解决传统透明骨骼标本必须保存在灌注甘油的容器中,不易于运输的问题,本研究探索小鼠透明骨骼塑化包埋标本的制作方法.首先制作出小鼠的透明骨骼标本,再对其塑化,并以UV胶作为包埋剂,通过紫外线照射,让UV胶快速地由液态转化为固态,对塑化好的透明骨骼标本进行包埋,获得坚固、便携的小鼠透明骨骼塑化包埋标本.本方法有利于透明骨骼标本的教学运用及标本产品的商业化推广应用.
对鲁教版初中生物学教科书中“非生物因素对某种动物的影响”的实验在材料方面进行改进,以期发挥烟台本地资源的优势,并加强对学生社会责任的培养.结果 发现,用海蟑螂作实验材料,配合自制装置进行实验能取得较好的实验效果.
前期研究表明,蛹虫草活性成分虫草素能有效抑制乳腺癌移植瘤的生长和转移,但其作用机制未清楚.本研究取三阴性乳腺癌移植瘤样品,通过转录组测序技术分析虫草素抗乳腺癌移植瘤的分子作用机制.结果表明,以P1为标准,筛选获得584个差异表达基因,其中上调基因69个,下调基因515个;KEGG分析表明,虫草素对乳腺癌移植瘤的分子调控涉及Hippo signaling pathway、Hedgehog signaling pathway、ECM-receptor interction、TGF-beta signaling