基于高通量测序的金钗石斛种子内生菌群落结构组成分析

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【摘要】

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本研究基于免培养和高通量测序技术,对金钗石斛种子内生菌16 S rDNA V 4区和ITS 1区扩增序列进行分析,揭示内生菌的组成和丰度。结果表明:扩增的内生细菌16 S rDNA序列归为13

【作者】

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杨立昌吴庆珊高阳陈千权王玉倩牛晓娟翁

【机构】

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贵州师范大学生命科学学院,贵州省教育科学院

【出处】

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种子

【发表日期】

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2020年8期

【关键词】

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金钗石斛种子高通量测序内生细菌内生真菌多样性

【基金项目】

：

微生物-植物互作及代谢调控,贵州省优秀青年科技人才(黔科合平台人才[2019]5655号);贵州省微生物-植物互作及代谢调控科技创新人才团队(黔科合平台人才[2019]5617号);NSFC-贵州喀斯特科学研究中心联合基金项目(U 1812401);贵州省优秀科技教育人才省长专项资金([2011]47)

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本研究基于免培养和高通量测序技术,对金钗石斛种子内生菌16 S rDNA V 4区和ITS 1区扩增序列进行分析,揭示内生菌的组成和丰度。结果表明:扩增的内生细菌16 S rDNA序列归为13 OTUs,隶属于变形菌门(Proteobacteria)和蓝细菌门(Cyanobacteria);其中变形菌门为优势门,泛菌属(Pantoea)为优势属;香农指数、辛普森指数和Chao 1指数分别为1.82、0.69和11.00。内生真菌序列归为14个OTUs,隶属于子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Ba

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