基于FPGA的分子动力学模拟动态数据流分析

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在分子动力学模拟众多加速平台中脱颖而出的FPGA却因为传统RTL较高的编程难度和设计时间得不到广泛应用。本文从FPGA新一代编程方案高层次综合(HLS)出发,探寻加速分子动力学模拟中关键路径的一些优化手段,发现了关键路径中存在动态数据流行为,分析得出了目前HLS还不能很好地描述这种动态数据流行为。
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