【摘 要】
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目的蛋白质磷酸化是通过激酶催化特定位点把磷酸基转移到底物蛋白质氨基酸残基的过程,是研究蛋白质活力及功能的重要机制。目前已鉴定的数千个磷酸化位点大多缺失激酶信息,为
【基金项目】
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国家自然科学基金青年基金(31501070);湖北省自然科学基金(2017CFB137)资助
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目的蛋白质磷酸化是通过激酶催化特定位点把磷酸基转移到底物蛋白质氨基酸残基的过程,是研究蛋白质活力及功能的重要机制。目前已鉴定的数千个磷酸化位点大多缺失激酶信息,为此本研究提出基于PU-learning的磷酸激酶预测算法,通过迭代标记磷酸位点,可以准确预测催化磷酸肽的磷酸激酶。方法首先该算法以PU-learning为框架,利用最大熵方差对不同种类的磷酸激酶自动筛选最佳阈值,从而提取每条磷酸肽上潜在的磷酸化位点,然后根据统计分析确定磷酸化位点对应的激酶,最后通过五折交叉验证该算法在Phospho.ELM数据库
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