【摘 要】
：
柑橘黄化脉明病(citrus yellow vein clearing,CYVCD)是一种危害柑橘的病毒病,克隆分析病原物序列信息对研发高灵敏检测方法具有重要意义.本研究从寻乌县温州蜜柑寄主上获得包含CYVCV的提取物,克隆CYVCV外壳蛋白(coat protein,CP)基因进行扩增测序和生物信息学分析.结果 表明,温州蜜柑叶片的CYVCV分离物的CP基因全长978 bp,编码325 aa,温州蜜柑CYVCV的CP基因序列与GenBank中收录的CYVCV的CP基因核苷酸和氨基酸序列相似度在97.1％
【机 构】
：
赣南师范大学生命科学学院,国家脐橙工程技术研究中心,赣州,341000
论文部分内容阅读
柑橘黄化脉明病(citrus yellow vein clearing,CYVCD)是一种危害柑橘的病毒病,克隆分析病原物序列信息对研发高灵敏检测方法具有重要意义.本研究从寻乌县温州蜜柑寄主上获得包含CYVCV的提取物,克隆CYVCV外壳蛋白(coat protein,CP)基因进行扩增测序和生物信息学分析.结果 表明,温州蜜柑叶片的CYVCV分离物的CP基因全长978 bp,编码325 aa,温州蜜柑CYVCV的CP基因序列与GenBank中收录的CYVCV的CP基因核苷酸和氨基酸序列相似度在97.1％～99.6％和95.5％～99.8％之间,与同为柑橘属的2种环斑病毒(ICRSV-K1和ICRSV-PU) CP基因的核苷酸序列和氨基酸序列相似性在74.0％～71.1％之间.与α线性科的其他病毒相似度均低于40％.在系统进化树中,系统发育树将CYVCV的CP分为3个类群,寻乌县温州蜜柑的CYVCV的CP蛋白与湖南甜橙和重庆尤里卡柠檬分离物CP蛋白聚成一簇,表明它们之间亲缘关系更近.本研究结果表明CYVCV的CP基因具有一定的分子差异,但变异比较保守,各地不同宿主间CYVCV亲缘性较高,这为进一步检测应用打下基础.
其他文献
胁迫是影响植物生长发育和农作物产量的重要因素.胁迫相关蛋白(stress associated protein,SAP)是一类锌指蛋白,广泛参与植物发育和胁迫响应.为了研究大豆SAP基因的功能,本研究以\'商豆1201\'为材料克隆了GmSAP3基因,并进行了生物信息学分析,采用RT-PCR分析该基因在大豆不同组织和温度胁迫下的表达模式.结果 表明,GmSAP3基因CDS序列全长为513 bp,编码170个氨基酸,GmSAP3蛋白等电点pI为6.79,分子量为18.30568kD;序列分析发现,G
以观赏凤梨\'卡丽\'的吸芽为材料,研究其组织培养技术,结果表明:观赏凤梨\'卡丽\'的吸芽可以被诱导分化出不定芽,以MS培养基为基础,增殖系数最高的培养基是MS+1.5mg/L6-BA+0.1mg/LNAA,增殖系数达到4.4;在1/2MS基础上,添加0.4mg/LNAA可以使生根率高达92.5％,生根天数最短为15天.
结合泰宁县国家基本气象观测站近50年(1968-2017年)的降水量、气温、相对湿度、日照时数等气象要素的变化趋势,对泰宁铁皮石斛种植的气候适应性进行分析,探究泰宁铁皮石斛种植过程中的不利气象条件以及其产生的影响,据此提出相应的防范措施和建议,以期提高泰宁铁皮石斛的产量和品质.
MYB是植物中数量众多且功能重要的转录因子家族.本研究通过生物信息学方法从未经注释的甘薯全基因组序列中筛选鉴定出MYB家族基因,分析了R2R3-MYB类基因的结构与功能.结果 发现,甘薯基因组中含有R2R3-MYB转录因子基因88个,均含有完整的R2、R3保守结构域,且R2、R3保守结构域中分别含有8个和9个高度保守的碱性氨基酸.MEME分析结果表明,甘薯R2R3-MYB蛋白序列中含有10个保守基序,其中80％以上的R2R3-MYB序列中含有motif 1、motif2、motif3、motif4、mot
光周期敏感性差异是影响玉米在不同光长条件下是否能够正常开花结实的重要因子之一.分析比较不同光照条件下热带玉米光敏型与光钝型自交系基因表达差异,能够为解析玉米光周期敏感性变异的分子机制提供更丰富的科学依据.本研究以光钝感自交系QR273和光敏感自交系T32为材料,通过人工控制光照长度分别对其进行长短日照处理,利用RNA-Seq技术对九叶期的基因组表达差异进行分析.结果 表明,不同光照条件能够影响昼夜节律和应答辐射相关基因的表达,其中昼夜节律相关基因在不同光照条件下的表达量均呈极显著性差异.结合材料的光周期反
植物MYB转录因子是功能多样、数量众多的转录因子之一,对植物的生长发育和代谢调控起着极其重要的作用.本研究基于彩色马铃薯块茎转录组测序数据,对彩色马铃薯发育过程中MYB转录因子基因进行筛选,并对其保守结构域、亚细胞定位进行分析;同时利用TMEV软件对其中R2R3-MYB转录因子的差异表达进行分析,并对差异显著的R2R3-MYB转录因子进行功能预测.结果 表明,基于转录组测序数据,筛选得到143个彩色马铃薯MYB类转录因子基因,根据结构特征分为4大类:1R-MYB、R2R3-MYB、3R-MYB和4R-MY
随着我国农村农业现代化,农村经济发展规模不断壮大,农村集体“三资”管理越来越是农民关心的热点问题,促进农村“三资”管理规范化是时代发展必然要求;分析当前长泰区“三资”管理存在问题,提出加强农村“三资”管理的若干意见.
MYB转录因子是植物中最大的一类转录因子家族,参与调控植物的生长发育、次生代谢、逆境胁迫等生物学过程.目前,关于高山杜鹃MYB转录因子的研究尚未见报道.本研究利用SMRT高通量测序技术对高山杜鹃品种\'富丽金陵\'进行转录组测序,得到了15.37 Gb数据,通过去冗余获得75002条转录本序列.其中,71155、33653、30359条转录本分别在NR、GO、COG数据库中具有匹配信息.基于高山杜鹃转录组数据,鉴定了64个转录因子家族,其中MYB基因有220个.根据结构特性将MYB基因分为4类:1
TTG1 (TRANSPARENT TESTA GLABRA1)基因编码具有WD40重复序列的蛋白,是调控植物花青素合成的重要因子.本研究以滇水金凤(Impatiens uliginosa)花器官为材料,采用RT-PCR技术克隆得到滇水金凤TTG1同源基因,其cDNA全长为1038 bp,编码345 aa,命名为IuTTG1.系统发育分析发现,IuTTG1与百脉根聚为一支,同源性达81.84％.通过荧光定量分析发现,IuTTG1在4种不同花色以及4个不同花发育时期的滇水金凤中均有表达,其中以深红色滇水金凤
试验以常规抹芽并施用抑芽剂,抹去3 cm以上腋芽并留存芽梗3～5 cm后施用抑芽剂,抹去全部腋芽不施用抑芽剂,预留倒2或倒3 一个腋芽、过5天后抹去并留存芽梗3～5 cm后施用抑芽剂四种处理进行对比研究.结果表明,各处理对中下部烟叶常规化学成分影响较小,但对上部叶烟碱含量影响较大,以抹去全部腋芽不施用抑芽剂处理的烟碱最高.留存芽梗3～5 cm后施用抑芽剂对烟株的腋芽生长有明显抑制效果,可以提升烟叶产质量,其产量2393.40 kg/hm2、产值62012.99元/hm2最高,值得在生产实际中推广应用.