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甲型H1N1流感病毒属于正黏病毒科，甲型流感病毒属。其核蛋白（NP）和基质蛋白（MP）不同。典型病毒颗粒呈球状，直径为80～120nm，有囊膜。囊膜上有许多放射状排列的突起糖蛋白，分别是红细胞血凝素（HA）、神经氨酸酶（NA）和基质蛋白M2。流感病毒不断抗凝漂移与抗凝转换。病毒颗粒内为核衣壳，呈螺旋状对称，直径为10nm。