桃YABBY转录因子家族的生物信息学分析

来源 :山东农业大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:itartan
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为了解桃中YABBY家族的成员和特征,本研究基于桃(Prunus persica)最新基因组组装注释数据,首次通过生物信息学手段系统鉴定并分析了YABBY基因家族特征,包括染色体定位、蛋白特征、基因结构、进化关系、保守结构域、启动子区域顺式元件。结果显示:桃中含有6个YABBY基因,分布在5条染色体上,其推导蛋白序列较短,分子量较小。家族成员含有4~6个内含子,结构较为复杂。桃中YABBY基因含有植物YABBY家族所有5个亚类,即CRC、INO、FIL/YAB3、YAB2和YAB5,且均含有保守的锌指结构
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