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干细胞依据它们的来源不同，大致可以分为两类：一种来源于胚胎，例如胚泡期内细胞群的胚胎干细胞（ES）及生殖嵴干细胞（EG），另一种来源于出生后组织的成人干细胞。ES细胞及EG细胞被认为是多能干细胞。目前认为，成人干细胞比我们先前想象的要具有更大的可塑性。无论是胚胎干细胞还是成人干细胞，其分化研究目前都是建立在动物模型体内进行，而这些实验很难阐明其分子机制及调控信号转导途径。