日本七鳃鳗（Lampetra japonica）口腔腺表达序列标签（EST）分析

来源 :遗传学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wilinne

【摘要】

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以日本七鳃鳗口腔腺为材料,构建库容量为2.1×106pfu/mL的cDNA文库.通过对文库中克隆子的序列测定和生物信息学初步分析,得到1 323条有效EST序列.经BlastX及BlastN软件进

【作者】

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高琪逄越吴毓马飞李庆伟

【机构】

：

辽宁师范大学生命科学学院,大连大学生物工程学院

【出处】

：

遗传学报

【发表日期】

：

2005年10期

【关键词】

：

日本七鳃鳗口腔腺 CDNA文库表达序列标签 Lampetra japonica oral gland cDNA library EST

【基金项目】

：

国家自然科学基金，辽宁省大连市优秀青年科技人才基金

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以日本七鳃鳗口腔腺为材料,构建库容量为2.1×106pfu/mL的cDNA文库.通过对文库中克隆子的序列测定和生物信息学初步分析,得到1 323条有效EST序列.经BlastX及BlastN软件进行同源对比分析,653条(49.36%)EST可在蛋白质或核苷酸水平上找到同源序列,其中328条与七鳃鳗科物种同源.同源序列功能分类大致分为11类,与蛋白质合成有关的蛋白所占比例最大.1 323条EST进行片段重叠群分析(contig analysis)获得包括547条序列在内的162组片段重叠群并确定

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