【摘 要】
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设计并应用60mer寡核苷酸基因芯片实现对SARS冠状病毒的检测。根据寡核苷酸基因芯片的原则设计出30条60mer的寡核苷酸片段,覆盖SARS冠状病毒(以最先提交全序列的TOR2株作为参
【机 构】
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第一军医大学分子生物学研究所; 广州军区总医院医学实验科 广州 510515; 广州 510515; 广州 510515;
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设计并应用60mer寡核苷酸基因芯片实现对SARS冠状病毒的检测。根据寡核苷酸基因芯片的原则设计出30条60mer的寡核苷酸片段,覆盖SARS冠状病毒(以最先提交全序列的TOR2株作为参考,GenBank登录号:AY274119)全基因组,点样制备成12×12的寡核苷酸基因芯片,从临床诊断SARS患者痰液标本抽提病毒RNA,采用限制性显示技术进行标记,将标记好的样品与芯片杂交,洗脱,扫描。初步探索寡核苷酸芯片诊断SARS冠状病毒的可行性。杂交结果表明,来自SARS患者样品与芯片上的多个SARS探针杂交,出现了明显的荧光信号;阴性和空白对照探针上没有杂交信号,而对照样品仅与3个SARS探针有杂交。由此可知,采用60mer寡核苷酸基因芯片可以从基因水平实现对SARS冠状病毒多段序列的平行检测,对于提高检出率有一定意义,此外,尚可用于监测在发病过程的各个阶段中病毒基因的活动状况。
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