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利用SSR标记法与盐溶蛋白法进行了鉴定玉米品种的对比试验。结果表明：盐溶蛋白法能很好地鉴定出供试的32份自交系和14个杂交种，且具有简单、快速、准确、稳定和低成本的特点；SSR分子标记法筛选了50个引物；用筛选出的多态性好的6个引物组合能鉴定出所有材料，具有独特的优越性。但设备要求高，成本相对较高，普及较困难。因此，在玉米品种鉴定上，应以盐溶蛋白法为主。