HLA-A^*0201限制性CTL表位肽分子力场分析

来源 :重庆工学院学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:fengyufengsc
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运用比较相似性指数分析(CoMISA)方法研究了203个HLA-A^*0201限制性CrL表位九肽结构与亲和性间的关系,另外30个表位九肽作为预测集用于检验模型的预测能力.得到构效关系模型结果q^2=0.548,r^2=0.963,F=553.4,SD=0.154.在CoMSIA计算中,当引入疏水场时,三维构效关系模型能得到明显改善.通过该三维构效关系模型,可较精确地估算预测集中30个CTL表位肽与HLA-A^*0201间的亲和力(rpred^2=0.532,SD=0.454).通过分析分子场等值面图在空
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