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大豆菌核病是一种检疫性病害，为害大豆植株的主茎、分枝和豆荚。发病部位先呈现水浸状，不规则形，浅褐色或近白色，可环绕茎部并向上下蔓延，病部以上枯死，病株在田间较易识别。空气潮湿时，病部产生絮状白色菌丝和黑色鼠粪状菌核，病茎髓部变空，菌核占其空间，茎秆易折断。在多雨年份，低洼地和过密田块大豆发病严重。豆荚变成褐色，腐烂，病粒萎缩，茎秆、叶柄上产生较大的黑色斑，影响商品性和降低产量。