【摘 要】
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目的:探讨lncRNA MALAT1在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的表达、生物学功能及其与患者预后的关系.方法:采用生物信息方法在TCGA数据库和Oncomine数据库中分析比较MALAT1在CRC患者癌组织和癌旁组织中的差异表达情况,并比较高低表达组患者总生存期(OS)和无病生存期(DFS)是否存在差异.采用cBioPortal在线分析TCGA数据库中MALAT1突变种类及频率.采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)技术检测我院收治并手术治疗的30例CRC
【机 构】
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河南大学淮河医院普外科,河南 开封 475000;河南大学淮河医院消化内科,河南 开封 475000
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目的:探讨lncRNA MALAT1在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的表达、生物学功能及其与患者预后的关系.方法:采用生物信息方法在TCGA数据库和Oncomine数据库中分析比较MALAT1在CRC患者癌组织和癌旁组织中的差异表达情况,并比较高低表达组患者总生存期(OS)和无病生存期(DFS)是否存在差异.采用cBioPortal在线分析TCGA数据库中MALAT1突变种类及频率.采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)技术检测我院收治并手术治疗的30例CRC患者手术切除标本的癌组织、癌旁组织、肠癌细胞系(SW620、LOVO、HCT116)及正常人肠上皮细胞(NCM460)中MALAT1的相对表达水平.小干扰RNA敲低SW620细胞中MALAT1表达后观察MALAT1细胞迁移和侵袭能力改变情况.siRNA下调SW620细胞MALAT1,利用免疫印迹实验检测上皮间质化标志物E-cadherin、N-cadherin和Vimentin的表达水平.结果:Oncomine数据库中,CRC患者癌组织中高表达MALAT1的研究有6项;30对人配对CRC组织标本中,相比癌旁组织,MALAT1在46.7％(14/30)的CRC患者组织中表达增高(P<0.05);Real-time PCR结果显示,肠癌细胞系(SW620、LOVO、HCT116)中MALAT1的相对表达量显著高于正常人肠上皮细胞(NCM460),差异有统计学意义(P<0.05).MALAT1基因突变类型主要为融合突变、扩增突变及深度缺失突变,其在各种肿瘤中的总体突变率为1.1％,在CRC组织中的突变率为0.34％.小干扰RNA抑制MALAT1表达可明显抑制SW620细胞的划痕迁移与小室侵袭能力.抑制MALAT1表达后,SW620细胞中E-cadherin的表达水平升高,同时N-cadherin和Vimentin的表达水平明显降低,表明上皮间质化过程受到明显抑制.MALAT1表达水平与结肠癌患者DFS存在明显的关系,高表达患者DFS显著低于低表达患者(HR=1.6,P=0.044).结论:lncRNA MALAT1在肠癌中表达上调,并通过抑制上皮间质化抑制细胞迁移和侵袭能力.MALAT1高表达结肠癌患者预后不良,可能成为结肠癌预后分子标志物.
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