【摘 要】
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目的基因组规模代谢网络模型(genome-scale metabolic model,GEM)是当前癌症代谢研究常用的一种分析工具,高质量的癌症代谢网络有助于人们了解癌症内部的代谢特征。泛癌代谢
【机 构】
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中国科学技术大学计算机科学与技术学院
【基金项目】
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国家重点基础研究发展计划(2017YFA0505502),安徽省自然科学基金(1508085MF128)资助
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目的基因组规模代谢网络模型(genome-scale metabolic model,GEM)是当前癌症代谢研究常用的一种分析工具,高质量的癌症代谢网络有助于人们了解癌症内部的代谢特征。泛癌代谢分析需要为多种癌症构造代谢网络模型,然而传统的直接基于癌症基因表达或蛋白质数据进行的网络重构方法,无法避免引入癌症所在组织的代谢特征,从而影响探寻疾病本身的代谢特点。为了削弱组织代谢特征对研究的影响,更加准确地提取癌症相对正常组织细胞在代谢层面上发生的变化,提出一种基于差异代谢网络的泛癌代谢分析方法。方法以癌症基因
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