龙眼体细胞胚胎发生早期SDG基因家族的全基因组鉴定与表达分析

来源 :热带作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangxu0202
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
SET domain group(SDG)基因家族控制的组蛋白赖氨酸甲基化,是参与染色质功能调控和表观遗传调控基因表达的重要部分。为了解龙眼(DlSDG)家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法进行龙眼全基因组SDG家族成员的鉴定,并对蛋白质结构域、保守基序、基因结构、启动子顺势作用元件、进化树、相关基因的蛋白互作和体胚发生早期的基因表达情况进行预测和分析。结果显示,龙眼SDG家族基因包括32个成员,分为Suv、Ash、ATXR5/ATXR6、Trx、E(z)、SMYD和SETD7个亚家族,其中Suv亚族成员数量最多;外显子数量在1~22个不等,蛋白结构域保守,都含有一个SET结构域,DlSDG蛋白保守motif不同亚家族间差异较大;DlSDG启动子包含许多诸如低温、干旱和压力等非生物胁迫响应元件和激素响应元件;龙眼SDG成员在体胚发生早期均能不同程度表达,其中DlSUVR4b在EC和ICpEC阶段可能发挥着较为重要的作用;DlSUVH4可以和DNA甲基转移酶MET1发生互作。本研究表明,龙眼DlSDG 32个组蛋白赖氨酸甲基转移酶基因可能除了在生物钟的调节、植物发枝数量、根的生长发育、种子的萌发、花的发育和植株的形态建成等方面发挥重要功能外,也可能直接参与胁迫响应和体细胞胚胎发生的调控,并且还可能在参与DNA甲基化、染色质重塑的过程中形成体细胞胚胎发生的协作调控网络,表现其具有功能上的多样性、复杂性。
其他文献
随着经济的发展,人们的物质生活水平不断提高,但是新的健康问题也在不断地出现。不合理膳食和不良生活习惯随着人群中高血糖、高血脂的比率不断扩大。据统计,正常人群发病率为20
目的:对比发现良、恶性胸腔积液胸膜改变的CT影像特征,以提高胸腔积液定性水平。方法:结合临床回顾性分析62例胸腔积液的CT胸膜改变。结果:62例胸腔积液中42例胸膜增厚,其中恶性
伽玛射线暴(Gamma-ray Bursts, GRBs,简称伽玛暴)是迄今为止人们观测到的最剧烈的高能天体物理现象,其剧烈程度可能仅次于宇宙大爆炸。自从20世纪60年代被发现以来,伽玛射线暴就以
针对锅炉制造现场出现的焊接质量问题,通过对材料、焊接过程和缺陷的分析,分析焊接缺陷产生原因,并提出对策,采取设计和工艺措施,杜绝此类问题在后续生产中再次发生。 Aimin
本研究以屠呦呦获得诺贝尔奖为例,试图了解科学事件在不同的媒介平台,传统媒体与社会化媒体上传播的情况。运用内容分析的方法,分析传统媒体、社会化媒体的新闻报道。研究发
目的:采用经会阴超声观察压力性尿失禁患者盆底结构特点。方法:279例压力性尿失禁患者按病情严重程度分为轻度组、中度组和重度组,另选取150例同期健康体检者作为对照组,采用
针对Auto CAD计算机辅助设计使用的广泛性,结合高职城乡规划专业特色进行课程改革。以工作过程系统化理论等职教理念为指导,对课程的教学内容进行重构,以项目教学代替传统式
实验室中的同位素Am-Be中子源在有关中子活化方法研究以及在核反应堆中子测量系统研制过程中的调试和刻度等方面都有着非常重要的作用。为使这些应用更有效并得到更准确的实
当前随着我国城市化建设发展速度不断加快,市政道路工程的使用规模正在不断扩张。在道路工程的施工过程中,道路工程施工管理工作是其中一个非常重要的工作环节,不但可以保证
发展乡村旅游是将乡村振兴战略落到实处的重大举措之一。分析桐城市乡村旅游的资源特征,运用SWOT分析法,对桐城市乡村旅游进行综合研究。研究结果表明:桐城市有地理位置优越